ในการประชุมสภามหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ ครั้งที่ 5/2559 เมื่อวันที่ 21 พฤษภาคม 2559 ได้จัดตั้งให้มีสำนักงานสภามหาวิทยาลัยขึ้น โดยมีฐานะเป็นส่วนงานในสังกัดมหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ และอยู่ในบังคับบัญชาขึ้นตรงต่อสภามหาวิทยาลัย ทำหน้าที่ด้านบริหารและธุรการของสภามหาวิทยาลัย
สำนักงานสภามหาวิทยาลัย มีการแบ่งหน่วยงานภายในเป็นฝ่ายประสานงานกิจการสภามหาวิทยาลัย ตามมติสภามหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ ครั้งที่ 5/2560 เมื่อวันที่ 5 เมษายน 2560 ต่อมาเนื่องจากในการประชุมสภามหาวิทยาลัยครั้งที่ 7/2562 เมื่อวันที่ 9 กรกฎาคม 2562 ได้มีมติอนุมัติแต่งตั้งคณะกรรมการตรวจสอบมหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒขึ้น เพื่อให้เป็นไปตามหลักเกณฑ์กระทรวงการคลังว่าด้วยมาตรฐานและหลักเกณฑ์ปฏิบัติการตรวจสอบภายในสำหรับหน่วยงานของรัฐ พ.ศ. 2561 โดยคณะกรรมการตรวจสอบมหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ ขึ้นตรงกับสภามหาวิทยาลัย และมีหน้าที่กำกับดูแลระบบงานตรวจสอบภายในของหน่วยงานของรัฐ ให้มีความเป็นอิสระเพื่อพัฒนาการปฏิบัติงานในหน้าที่ ดังนั้น เพื่อให้การดำเนินงานของสำนักงานสภามหาวิทยาลัย ซึ่งทำหน้าที่ด้านบริหารและธุรการของสภามหาวิทยาลัย ตอบสนองบริบทของสภามหาวิทยาลัยในการควบคุมดูแลกิจการมหาวิทยาลัย สภามหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ ในการประชุมครั้งที่ 10/2562 เมื่อวันที่ 8 ตุลาคม 2562 จึงมีมติให้ปรับโครงสร้างสำนักงานสภามหาวิทยาลัย โดยแบ่งหน่วยงานภายในสำนักงานสภามหาวิทยาลัย ดังนี้
1) ฝ่ายกิจการสภามหาวิทยาลัย
2) ฝ่ายติดตามและประเมินผล
3) หน่วยตรวจสอบภายใน
สำนักงานสภามหาวิทยาลัยเป็นส่วนงานสนับสนุนและขับเคลื่อนการดำเนินงานของสภามหาวิทยาลัยในเชิงนโยบายและพัฒนาขึ้นตรงต่อสภามหาวิทยาลัย โดยมีผู้อำนวยการสำนักงานสภามหาวิทยาลัยเป็นผู้บริหารสำนักงาน ภายใต้การกำกับดูแลของนายกสภามหาวิทยาลัยและเลขานุการสภามหาวิทยาลัยนับจนปัจจุบันมีผู้อำนวยการสำนักงานสภามหาวิทยาลัย ดังนี้
1. ผู้ช่วยศาสตราจารย์ ดร.ทพ.ณัฐวุธ แก้วสุทธา ปฏิบัติหน้าที่ผู้อำนวยการสำนักงานสภามหาวิทยาลัย (พ.ศ.2559 – พ.ศ. 2560)
2. รองศาสตราจารย์ ดร.ลัดดาวัลย์ ผิวทองงาม ปฏิบัติหน้าที่ผู้อำนวยการสำนักงานสภามหาวิทยาลัย (พ.ศ. 2561 – พ.ศ.2562)
3. รองศาสตราจารย์ ดร.อุดมศรี โชว์พิทธพรชัย ผู้อำนวยการสำนักงานสภามหาวิทยาลัย (พ.ศ. 2562 – ปัจจุบัน)